第三章:实时荧光定量PCR的应用
一、相对定量测定不同样品中基因表达量的相对值
在进行基因表达量的相对测定时,内参基因的选择至关重要。选择合适的内参基因可直接影响结果的有效性。具体原则如下:
- 始终选择表达丰沛且均一的基因作为内参基因;
- 避免盲目选择使用频率较高的内参基因;
- 常用的内参基因包括GAPDH、Actin和Tublin。
经过内参基因的引入后,结果即可以进行进一步计算。
二、绝对定量
绝对定量是指通过标准品来测定样品中基因表达量的绝对值(拷贝数)。标准品包括:
- A/克隆质粒
- B/PCR产物
- C/cDNA(注意扩增效率的测定等用途,但不适用于绝对定量)
拷贝数计算依据平均分子量(MW)进行。例如:
- dsDNA:拷贝数 = (碱基数) x (660道尔顿/碱基)
- ssDNA:拷贝数 = (碱基数) x (330道尔顿/碱基)
- ssRNA:拷贝数 = (碱基数) x (340道尔顿/碱基)
拷贝数计算公式为:
(602 x 1023 拷贝数/摩尔) x (浓度 g/ml) / (MW g/mol) = copies/ml
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